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- 国家自然科学基金重点项目（项目负责人：蒋兴宇），“器官共形适配的生物检测系统”，2023-2027
- 国家重点研发计划合成生物学重点专项（项目负责人：蒋兴宇），“使用合成DNA进行数据存储的技术研发”，2019-2024
- 国家自然科学基金委重点项目（生物医学工程，项目负责人：蒋兴宇），“利用微流控/纳米技术构建血管/神经网络用于再生医学”，2018-2022
- 国家自然科学基金委重点项目（项目负责人：蒋兴宇），“基于微流控芯片的循环肿瘤细胞无标记分选及基因检测新方法研究”，2016-2020
- 国家自然科学基金委国际(地区)合作与交流项目（A3前瞻项目负责人：蒋兴宇），“利用纳米生物材料进行肿瘤生物学中关键分子事件的纳米尺度的成像和示踪”，2013-2018
- 国家自然科学基金委杰出青年基金（负责人：蒋兴宇），“分析化学”，2011-2014，
- 国家自然科学基金委重大项目（课题负责人：蒋兴宇），“微纳流控生化分析集成系统的研究”，2009-2012
- 人类前沿科学计划组织（Human Frontier Science Program Organization，HFSPO）的“青年科学家奖”项目,“利用微纳米器件研究细胞的形态变化和进化”，2007-2009